
2024年9月由上海占农业的大部分高中张万刚讲解公司在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物技术为该研究提供了亚硝基化体现组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文名字名称:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
论文期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2026年引响系数:5.7
发过用时:2024年9月
顾客厂家:南京农业大学
科学研究素材:蛋白
拜谱出具技术设备:亚硝基化修饰组学
的技术自驾路线:
一、深入分析效果
01.Caspase-3活性酶类
近年尚不很明白NO对caspase-3的抑建设用的作用有没归因于NO介导的S-亚硝基化,不一样的浓度值均值的GSNO用于外源性NO生产商,以引导caspase-3的身体S-亚硝基化。报告单得出结论,与并没有GSNO的组相较,100、200和400μM GSNO组的caspase-3特异性为显著下降(图1),与前者新闻报道一样的。GSNO治理 下降caspase-3特异性的意向愿意仍仍待确立。
图1 有所不同渗透压的GSNO工作对caspase-3活性酶的干扰
02.Caspase-3的S-亚硝基化限度
的调查Caspase-3的亚硝基化层度上,以反映GSNO对Caspase-3的遭受反应性。经GSNO清理后,论文论文检测到caspase-3蛋白酶S-亚硝基化密度加大(图2)。哪些导致反映,外源性GSNO塑造培养可取得成功分析caspase-3的身体之外S-亚硝基化。可笑震惊的是,在如果没有GSNO出现的对比组中论文论文检测到个微亮的S-亚硝基化带,这反映caspase-3将遭受内源性的S-亚硝基化。还有,本的调查中caspase-3的S-亚硝基化层度上较高,而caspase-3的活性酶下降,这与之后的的调查不符。不过,caspase-3的特女性朋友S-亚硝基化掩盖位点尚不很清楚,还要进两步的科学探索。
图2 GSNO整理对caspase-3S-亚硝基化级别的直接影响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化遮盖组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。蓝标志的字段透露S-亚硝基化肽,桔红色标志的C透露S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3吸附结蛋白酶
结球血清作为一个是一种重点的内部骨架球血清,在确保肌内部构成类型的构成类型完好详细性和抽缩性层面起比较偏重点目的,研发S-亚硝基化caspase-3对结球血清挥发的过敏性兼备重点意义所在。与Std(未用胱天球血清酶-3和GSNO孵育的起始肌食物纤维材料球血清)组相较于,0 μM GSNO组(肌原食物纤维材料和caspase-3的孵育,无GSNO)的完好详细结球血清含氧量有效大幅度降低,提醒caspase-3对结球血清兼备隐性的球血清淀粉水解本事。在GSNO孵育后,完好详细结球血清的含氧量突出加大(P < 0.05)。凡此种种,当GSNO含量提升时,完好详细结球血清的含氧量长期调整(P < 0.05)(图5)。一项发觉发现,SNO绘制的caspase-3以技术水平依赖感的习惯治理和改善结球血清的挥发。
图5.S-亚硝基化caspase-3可降解结蛋白质
05.S-亚硝基化Caspase- 3分解肌钙蛋清-T
肌钙球核球球蛋白酶质质-T (TnT)是原肌球球核球球蛋白酶质质的调控承接健身肌肉紧缩的细细的的必要肌原弹性黏胶化学纤维球核球球蛋白酶质质。TnT的光吸附塑料塑料的特点是在线探测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化经济条件下,caspase-3对TnT的光吸附塑料塑料现状如图甲如图所示6如图所示,与Std组(不包括caspase-3和GSNO的肌原弹性黏胶化学纤维)相对来说,caspase-3组中30 kDa TnT细节描写特殊增高,证明caspase-3参与性了TnT的光吸附塑料塑料,然而,caspase-3与GSNO的孵育形成30 kDa TnT减退。在100和200 μM GSNO组区间内没在线探测到很深的文化差异(P > 0.05),而当GSNO的有机废气浓度实现400 μM 时,该细节描写特殊才能减少(P < 0.05)。这一些看到证明了SNO遮盖的caspase-3对TnT光吸附塑料塑料的治理和改善功能。结球核球球蛋白酶质质和TnT是caspase-3的强烈底物,而GSNO净化处理削减caspase-3的吸附性概率形成肌原弹性黏胶化学纤维球核球球蛋白酶质质光吸附塑料塑料程度上削减。结合以上所说,NO引导的S-亚硝基化需要顺利通过遮盖半胱氨酸残基来的调控caspase-3的吸附性,借以加大力度骤的影响到其对结球核球球蛋白酶质质和TnT的球核球球蛋白酶质质油脂水解力量,为了的影响到牛羊肉产品。
图6. S-亚硝基化caspase- 3化学降解肌钙蛋白质-T
二、个人总结
本钻研亟需论述S-亚硝基化对caspase-3突显的影向简述随着对鸡肉片肌原人造纤维棉休外光降解的影向。蛋清S-亚硝基化能够突显caspase-3的半胱氨酸残基,故而引起caspase-3催化活性消减,进一大步治理和改善了其对鸡肉片肌原人造纤维棉蛋清的蛋清溶解能力素质。三、拜谱总结
探讨选取了酶活测试,亚硝基化体现组学讲解,WB等测试行为,会发现血清S-亚硝基化可不可以体现caspase-3的半胱氨酸残基,这出现了caspase-3活力性的影响,齐头并进一大步克制了其对羊肉肌原纤维板血清的血清淀粉水解专业能力。本探讨为描述血清质亚硝基化对口感的宏观调控体制给出一个多个新的层面。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的核脂肪酸组学、突显核脂肪酸组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸服务系列服务,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total硫化还原成、解离巯基,欢迎大家咨询!
符合文献资料:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663