
近日,成都医科学校时首要附加门诊王学浩院士评选创业团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向治疗能量是什么代谢转化检测分析服务。
因为问题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文名网站标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客服公司:南京医科大学
研发的材料:细胞
拜谱提供了业务:转录组测序+球蛋白互作组+靶向疗法动能分解组
方法路径:
研究探讨效果
01、YBX1被技术鉴定为HCC中糖酵解的要点表观遗传
本科研采样HCC癌肿样表(n=7)的单内部RNA测序参数集采取深入了解,感觉糖酵解吸附性注意一起在癌肿内部中,hdWGCNA深入了解辨别的出9个表观遗传控制器(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的求生深入了解知道YBX1为自立求生风险分析主观因素(图1H)。进1步结合起来IHC、WB研究和癌肿进行与毗邻非癌肿进行的地方转录组学参数集确认YBX1是肝内部癌缓解的内在靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确立为设定HCC受损细胞糖酵解的关键点基本要素
02、YBX1可以淡化HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物力量基础代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1增进HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1相结合并增进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1搭配并增进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化减弱其磷碱化,以此可以淡化其核转位
进一次加测YBX1的O-GlcNAc糖基化是影响力其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC组织中或用OGT压中药制剂OSMI-1工作,YBX1蛋清能力为正相关减轻,YBX1磷硝化作用为正相关少(图4A-C)。IP工作显现,在重复的Flag-YBX1底物能力下,YBX1-WT的磷硝化作用能力为正相关多于YBX1-T57A,是由于磷硝化作用的加剧不禁仅是由于更快的YBX1蛋清表达出方式(图4D)。溶合了核和质多组分遇到TMG工作的HCC组织中YBX1核表达出方式的上升(图4E-F),进一次遇到YBX1磷硝化作用的关键性调试要素是AKT(图4G-I)。这样的遇到认为O-GlcNAc糖基化顺利通过增强学习其磷硝化作用来增强学习YBX1蛋清比较稳定量分析并增强学习核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 装饰不方便其进三步形成磷过酸装饰并才可以增进其核转位
05、YBX1提高网站PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1驱动PKM2转录
06、YBX1 也可以提升组球蛋白乳碱化掩盖技术
钻研察觉到YBX1敲低强势减小淀粉酶质乳酸性反应,更是要格外重视是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解阻止剂2-DG的进行实验否认了糖酵解与组淀粉酶乳酸性反应的之间绑定,阻止糖酵解可强势减小H3K18la能力(图6D)。PKM2过呈现可逆转转YBX1敲低引致的H3K18la减少,到外源乳酸处置这样不仅减弱H3K18la,还伴有YBX1呈现调整,建议出现朝回访(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR否认,H3K18la实现聚集于YBX1再启动子之间推进其转录,该时候受O-GlcNAc糖基化调节(图6H-J),并察觉到P300 调整是YBX1减弱H3K18乳酰化做用的机能(图6K-L)。
图6.YBX1增強H3K18乳过酸体现标准
文章标题总结
在这方面深入分析中媒体报道了YBX1在HCC中高描述,或者与糖酵解析切有关系。YBX1在T57处被O-GlcNAc淡化,导致平稳淀粉酶酶质并加剧其描述。上述种淡化还可以淡化YBX1在T57处的磷过酸,可以淡化其核易位。因,上述工作开展了糖酵解有关系染色体的转录并刺激性乳酸的诞生。虽然,YBX1成功激活P300的转录,而能驱动软件组淀粉酶酶的乳过酸,特别是H3K18la,H3K18乳过酸双向控制YBX1染色体转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隐性基因正反面馈环体系图
拜谱个人总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物体为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶点电能分解组技术服务,拜谱怪物建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、翻泽后装饰组学、代谢转化组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
基准期刊论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.