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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 手机网络药剂学学论述草酸钙肾结石被氧化应激性和细菌感染磨损体系

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿设备最经熟悉的疾病症状之首。肾策划 中CaOx结晶体过饱和累积会引发肾小管细胞系拉伤和凋亡,然而引发肾结石的转变成。短链皮下脂肪的酸由消化道内厌氧面团发酵菌类面团发酵饮食营养纤维素产生了,不但在轮廓线消化道防御机系统中充分调动用途,可是在设备质量上也充分调动最为关键的用途。当中,丁酸是最多种多样的短链皮下脂肪的酸,有着抗感染和免疫细胞减弱用途,本论述初探丁酸对CaOx肾结石的用途以至于因素靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医院科室泌尿整形科吴忠专家教授、周子健研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教援、周子健搏士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物体与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网上药剂学学保障,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

软文标题:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 消费者机构:华山青岛博士整形医院医院 探究因素:大鼠、HK-2组织细胞 分组名数据:差表组(Con)、沙盘模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱可以提供技术应用:网咯药剂学学论文检测

基本思路工作步骤

研究分析报告

钻研分析工作人员先引入大鼠型号工具,借助人体生理什么是生化指标体系和聚集病理报告学脱色等钻研分析伎俩出现丁酸不错才能减少CaOx型号工具大鼠肾CaOx晶状体的转变成和受伤,改善效果CaOx型号工具大鼠的感染受伤和空气钝化成分的过度的展现。还有,丁酸还可调控草酸诱发的HK-2血组织细胞受伤、空气钝化应激状态和血组织细胞凋亡。 为探索丁酸构造和靶遗传dna系统,探析工人从PubChem想要高效率的获取到丁酸和丁酸酯的二维和二维构造(图1A)。顺利通过PharmMapper数据信息源报告库和Uniprot数据信息源报告库除理后共选择出117个丁酸靶遗传dna供进一个步骤定性了解。将遗传dna目录导出来STRING数据信息源报告库,来进行PPI系统定性了解。Cytoscape说出了去重复的前20的核心靶遗传dna的图解系统图,其中包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这样的核心遗传dna与系统中的其它遗传dna均行为 出某种的关键性性,说明书怎么写这样的遗传dna会推动着联动功用。GO和KEGG定性了解折射出了丁酸核心遗传dna的关键性手段和生态学学实用功能(图1C)。核心遗传dna核心与类固醇缴素回应、硫化物应激性反馈回应、活性酶氧氧神经元对类固醇缴素敏感的反馈以其对咸性化学反應有害物质的反馈关与。所诉所诉,这样的核心遗传dna核心参与进来了硫化物应激性反馈和对活性酶氧氧的生态学反馈的过程 ,是肾结石养成制度中至关关键的手段,这是因为丁酸会在肾结石中推动关键功用。

图1| 丁酸设备构造与靶dna网络数据探讨(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进两步深入深入分折丁酸对CaOx肾结石确实切靶遗传DNA,深入分折员根据GEO数剧库对GSE73680中建康比较与CaOx肾结石病患的遗传DNA差别的完成了深入分折。比较组与CaOx结石病患的差异性性好别的理解遗传DNA(DEGs)检查规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个遗传DNA时有发生差异性发展,这其中3379个(89.4%)遗传DNA理解调涨,404个(10.6%)遗传DNA理解上涨(图2A)。对DEGs完成聚类分析分折分折,热图彰显了前10个被选中DEGs的二维分出层次聚类分析分折显著特点(图2B)。接着,深入分折员能够GeneCards数剧库人工客服技术鉴定了370个已经与CaOx肾结石有关于的遗传DNA,排在前20位的推测遗传DNA非常有关于性评价如下图2C随时。以便寻找到丁酸的治疗CaOx肾结石的重点靶点,深入分折员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关于遗传DNA工作赢得一堆个Venn图。决定性,CYP2C9被判别为丁酸后果CaOx肾结石的潜在性的靶点(图2D)。虽然,深入分折员还完成了丁酸与CYP2C9的分子结构指导,CYP2C9的八个蛋白质残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸相护能力,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在使用网站药理学学精准预测CYP2C9是丁酸反应CaOx肾结石的靶染色体后,的研究技术人员还经过上皮人体细胞检测得知了CYP2C9可拉低草酸介导的HK-2上皮人体细胞的ROS平均水平、感染神经损伤和凋亡。

图2| 大多据库携手分析一下推测CYP2C9是丁酸功能于CaOx肾结石的靶基因遗传

设计结果显示

本深入分析一方面会发展丁酸在身体和身上均能调节CaOx肾结石三维模型的硫化物应激状态状态和发炎板材损害,然后能够 系统临床药理学学建立收获丁酸引响CaOx肾结石的潜在性的靶点——CYP2C9,第四能够 组织血细胞實驗否认CYP2C9在草酸盐引发的HK-2组织血细胞ROS总体水平、发炎板材损害和凋亡。哪些会发展体现了丁酸很有可能能够 调节CYP2C9来调节CaOx肾结石的硫化物应激状态状态,消减发炎板材损害。相应过程中中拜谱菌物带来了系统临床药理学学高技术水平贴心产品,除外拜谱菌物可增加成熟期加强制度建设的dna组学、球蛋白组学、基础代谢组学等几组学成品及高技术水平贴心产品,青睐详询咨询服务! 参照论文参考文献:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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