
2023年4月2日,西班牙科尔多瓦大学Tomas Cerdo等人在Cell Host & Microbe(IF=30.3, 2023)杂志发表了题为“Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice”的文章。研究人员使用16S rRNA测序、宏淀粉酶质组学和消化吸收组学研究揭示了婴儿认识和肠道菌群之间的联系。结果显示认识能力较好的婴儿肠道菌群可以增强小鼠的记忆,并调节了小鼠外周血皮层(PRC)的组氨酸代谢组,这些结果表明“肠脑轴”在婴儿时期就起到至关重要的作用。
用英语微信标题:Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice (Cell Host & Microbe,IF=30.3, 2023)
中文名主题:婴儿肠道微生物群有助于小鼠的认知表现
组学技能:16S rRNA+宏蛋白质组学+代谢组学
样板信息内容:婴儿粪便、小鼠粪便
科研一个构想
(图源:Tomas Cerdo, et al., Cell Host & Microbe. 2023)
核心论述导致
01、小宝宝把握技能和消化道菌群设备构造的相关
首先,研究人员基于贝利婴儿发育量表(BSID-III)数据,根据6个月大的婴儿在复合认识、语言和运动三个领域的得分,将婴儿分为高于中位数组和低于中位数组。通过对婴儿粪便样本进行16S rRNA分析,发现唯一与肠道微生物群落结构密切相关的BSID-III量表是复合认识(CC)。 与小于CC中数字组(Inf-belowCC)的幼儿相对来说,不低于CC中数字组(Inf-aboveCC)的幼儿可以使肠胃菌群有着更加高的粗糙性( 图1A)。在属水平上,Inf-aboveCC组的肠道菌群中杆菌、链球菌、拟副杆菌、严格感梭菌、霍氏杆菌和瘤胃球菌富集,而无毛螺科、嗜血杆菌和乳球菌的显著减少(图1B-D)。上述结果表明, 交往意识有差异性的新生婴儿,其消化道微生物学制品在群落组成部分共同点上有可观差异性 。
图1. Inf-aboveCC和Inf-belowCC组宝贝肠子菌微博黑名单成结构特征
02、产品结识业务能力涉及的宏蛋白酶质组特征描述
为了探究与婴儿认识相关的肠道菌群功能特征,研究人员采用宏蛋白酶质组学对婴儿粪便进行分析。结果表明,Inf-belowCC组的肠道菌群富含参与细胞内运输分泌和囊泡运输的蛋白质,而Inf-aboveCC组中参与碳水化合物运输和代谢的蛋白质有增加的趋势。稀疏偏最小二乘判别分析(sPLS-DA)图显示,婴儿宏蛋白质组(图2A)和促进区分的已鉴定蛋白质组(图2B)之间存在明显区别。组氨酸酶(HutH)是Inf-aboveCC宏白质组中并不是显著性含有的球营养素。随后,研究人员通过DESEq2差异丰度分析(图2C)和Wilcoxon检验进一步证实了上述结果,组氨酸分解代谢的两种下游酶尿糖酸脱水酶(HutU)和咪唑酮丙酸酶(HutI)在Inf-above CC宏蛋白质组中丰度较高。上述分析结果揭示了与婴儿认识能力相关的宏蛋白质组特征。
图2. 宏血清质组学生物富集具体分析
03、组氨酸消化吸收与孩子了解实力有关的
宏蛋白质组学数据和生化实验结果表明婴儿组氨酸代谢与认识能力相关,因此,研究人员开发一种靶向疗法新陈代谢组学方法用于定量分析组氨酸代谢物水平(图3A)。结果表明Inf-aboveCC组婴儿粪便中的尿酸盐水平显著降低,而其余组氨酸代谢物则无差异(图3B)。研究人员进一步检测了婴儿尿液中的组氨酸代谢物,结果显示与Inf-belowCC相比,Inf-aboveCC组婴儿尿液中组胺、组氨酸和尿酸水平显著升高(图3C),且Inf-aboveCC组粪便中的尿酸盐/组氨酸比值(图3D)和尿液中的组胺/尿酸盐比值(图3E)显著降低。粪便中的尿酸盐/组氨酸比值与unclass_lachnospirace_41和Lachnospiraceae incertae sedis属呈负相关,与Bacteroides_3呈正相关(图3F)。尿液中的组氨酸水平与Streptococcus_42和Bacteroides属呈正相关,而尿酸水平与Holdemanella_16呈负相关,与链球菌属呈正相关(图3G)。
图3. 组氨酸分解与新生宝宝看法技能有关的信息
04、婴幼儿供体的肠子菌群小鼠复制
最后,为了调查肠道微生物群是否有助于认知,研究人员进行了一项粪便微生物群移植(FMT)实验。结果表明,将Inf-aboveCC供体的粪便移植到GF小鼠体内,其记忆功能优于Inf-belowCC供体的小鼠(图4)。被婴儿肠道菌群定植的小鼠拥有与记忆功能相关的不同细菌分类群,认知表现较好的婴儿微生物群小鼠表现出更高的记忆功能,包括Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium物种在内的丰富分类群以及不同的组氨酸代谢组学特征(图4B),其中,毛缕菌科和拟杆菌类与婴儿认知的关联在人源化小鼠中得到了复制。此外,与接受Inf-belowCC肠道微生物组的小鼠相比,接受了Inf-below cc肠胃微怪物组的小鼠HutH化学活化都更好。总之,这些结果表明通过婴儿供体的肠道菌群粪便移植的记忆功能可以传播给GF小鼠,表明肠道菌群可以作为一种促进记忆的实体。
图4. 被幼儿胃肠菌群定植的小鼠享有与记忆里功能性相关内容的各种不同结核杆菌等级分类群
总结
综上所述,的研究方案人数采用16S rRNA测序、宏淀粉酶质组学和分解细胞排泄组学了解搭建了宝宝组氨酸分解细胞排泄组与的了解相互的绑定,高并发现了一大个与结识到效果关与的的分解细胞排泄酶—组氨酸酶(HutH)。HutH标准的不一还有不一的排泄物和小便组氨酸分解细胞排泄组与宝宝的了解关与。因此,采用宝宝供体的肠管菌群排泄物移殖的记忆英语模块就可以宣传给无菌检测小鼠,结识到效果比较好的宝宝供体移殖小鼠含高Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium等与的了解效果关与的革兰氏阴性菌。的研究方案表面宝宝软型的了解和肠管菌微博黑名单成相互的绑定更早在6十一个月时就搭建了 了,组氨酸分解细胞排泄物标准的调整不是种潜在性的逻辑。拜谱总结ppt
本研究通过16S rRNA测序和宏球膳食纤维组学分析使组氨酸酶在婴儿认识中的作用脱颖而出,并通过代谢组学和粪便移植的方法进一步验证,多方面详述了在婴幼儿-猪粪胚胎移植小鼠体制中胃肠道菌群对看法本事的影向,为“肠脑轴”在婴幼儿末期的未来发展和用机理展示 了新的明白。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供蛋白质组学、代谢组学、修饰组学、16S rRNA测序等多组学技术,结合组学技术拜谱生物也推出了针对不同样本和研究领域的多组学研究方案,包括肠道篇、血液篇、医学篇等,帮助客户解决研究难题,助力多篇高分文章的发表,欢迎大家咨询!
分类文献综述:Tomas C, Alicia RR, Inmaculada A, et al. Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice. Cell Host & Microbe. 2023, 31(12): 1974-1988. doi: 10.1016/j.chom.2023.11.004.